Cuando en 2003, tras una primera participación en el campeonato de MotoGP en 1971, Ducati volvió a competir en la categoría reina con la Desmosedici, junto a Troy Bayliss se encontraba uno de los veteranos de MotoGP: Loris Capirossi.
Ganador en 1990 y 1991 del campeonato del mundo de 125cc y campeón de 1998 en la categoría de 250cc, Loris afrontaba el nuevo desafío con entusiasmo, demostrando el increíble potencial de una moto que no siempre era fácil de manejar.
La Desmosedici de Capirossi tuvo un debut espectacular en la primera carrera en Suzuka en 2003, liderando la carrera al final de la primera vuelta y terminando en tercer lugar.
Tres meses después, en junio de 2003, logró una histórica e increíble victoria en Cataluña, terminando su primer año de MotoGP en la tercera posición de la clasificación final.
Si bien la temporada 2004 no fue tan exitosa, en 2005 Loris Capirossi ganó dos veces con la Desmosedici montada con neumáticos Bridgestone, mientras que en 2006 lideraba la clasificación antes del accidente que interrumpiría su temporada.
En 2007, junto a Casey Stoner, Loris concluyó su experiencia con el equipo oficial Ducati ganando en Japón el mismo día en que Stoner ganó el título de piloto.
Después de un período con Suzuki, Capirossi concluyó su carrera de 20 años en 2011, nuevamente montando una moto de Borgo Panigale, compitiendo para el equipo Pramac Ducati.