La nueva caja de cambios prevé un alargamiento de la relación de la primera, segunda y sexta marcha. Esta nueva relación de marchas SBK está por tanto más "orientada a la competición", más adecuada para su uso en pista.
La primera marcha se ha alargado en un 11,6%, mientras que la segunda en un 5,6%. Gracias a esta nueva caja de cambios, ahora es más fácil afrontar las curvas más cerradas en primera, disfrutando de una mayor frenada del motor y una mejor aceleración a la salida de las curvas. Además, el menor salto de velocidad entre las dos primeras relaciones permite al DQS, dotado de un nuevo calibrado, trabajar con mayor eficacia, ofreciendo mejores prestaciones. Por último, la sexta marcha se ha alargado un 1,8%.

El Power Mode Full es el más deportivo jamás adoptado por una Panigale V4 y permite al motor expresar todo su potencial con curvas de par sin filtros electrónicos, excepto en la primera marcha. Para los Power Mode High y Medium se ha desarrollado un nuevo sistema de gestión de mapas Ride by Wire, ahora dedicado a cada una de las seis marchas, que garantiza al piloto la posibilidad de tener siempre el empuje óptimo al abrir el acelerador. El Power Mode Low, por su parte, ha sido concebido para hacer aún más agradable la conducción en carretera, limitando la potencia máxima de la moto a 150 CV y ofreciendo una respuesta del acelerador especialmente manejable.