Dopo dieci anni di vittorie nel Campionato del Mondo Superbike prima con la 916 e poi con la sua discendente 996, nel 2003 Ducati presenta la 999 che subito monopolizza il podio della prima gara stagionale con i piloti ufficiali Ducati Fila, Neil Hodgson e Rubén Xaus.
A bordo della sua moto numero 100, il britannico Neil Hodgson vince undici delle prime dodici gare, conquistando così il titolo di Campione del Mondo Superbike del 2003.
La 999 domina l’intera stagione e Hodgson ottiene altre due vittorie e sette secondi posti.
A fine stagione, il britannico fa disegnare una riga rossa sul doppio zero del suo numero di gara, trasformando così il 100 usato fino a quel momento nel numero 1 di campione del mondo.